2016年7月19日，重慶國家自主創新示范區獲得國務院正式批復，要求充分發揮重慶產業優勢、體制優勢和開放優勢，打造具有重要影響力的西部創新中心，努力建設成為創新驅動引領區、軍民融合示范區、科技體制改革試驗區、內陸開放先導區。目前，自創區以《中國開發區審核公告目錄》（2018年版）明確的自創區四至范圍為核心，涵蓋重慶高新區、璧山高新區、兩江新區直管園。自自創區獲批以來，重慶市委、市政府高度重視，建立了由唐良智市長任組長、各市級部門主要負責人任聯絡員的自創區工作領導小組，按照《重慶國家自主創新示范區建設實施方案》明確的工作任務，統籌謀劃推進自創區建設各項工作。

1．政策持續先行先試，改革創新成效顯著。一是強化金融要素支持。圍繞科技企業創新發展需求，重慶高新區出臺《高成長性科技企業扶持辦法》、《重慶高新區中小微企業“助保貸”管理辦法》等文件，強化科技企業研發投入補助、貸款貼息和房租補貼等專項扶持，推動知識價值信用貸款、種子基金擴面放量，知識價值信用貸款2021年一季度發放貸款2100萬元，累計為281家次企業發放貸款6.05億元。二是探索創新成果轉化辦法。試點推行《科技成果轉化管理辦法》，在兩江新區推進鼓勵科技成果入股試點，從支持團隊創辦科技型企業、技術成果入股等方式創新成果轉化機制，技術成果入股所占注冊資本比例最高可達到100%；三是創新國有資產管理模式。璧山高新區成立重慶高新技術產業研究院，以“利益共享、風險共擔、資源匹配、綜合收益”為原則建立混合所有制目標公司，促使專利持有者、員工積極參與對孵化項目經營風險管控，防止國有資產流失，確保國有資產保值增值。

2．新興產業漸成態勢，科技企業集聚成群。一是聚焦優勢打造創新型產業集群。重慶高新區緊跟全球前沿科技趨勢、國家戰略性新興產業布局重點、獨角獸企業爆發領域，搶抓區域戰略及產業轉型市場機遇，聚焦新一代信息技術產業、先進制造業、大健康產業、高技術服務業，打造創新型產業集群。兩江新區重點打造新一代信息技術和新能源及智能汽車兩大千億級產業集群。二是強化科技企業培育。重慶高新區圍繞企業培育重點，組織推進2021年重慶高新區科技企業科技創新政策宣講會、2021年度重慶高新區瞪羚企業、獨角獸企業、高能級領軍企業及第一批高新技術企業申報等工作，一季度科技型企業增加56家、累計達829家。兩江新區引導企業圍繞產業鏈核心技術和關鍵環節加大科技攻關，重點培育易智網、可蘭達、博拉5G視頻產業園等具有高成長性的項目，新晉馬上消費金融、零壹空間等潛在獨角獸企業及聚土網等新晉潛在獨角獸企業。三是開拓產業發展新模式。璧山高新區形成“產業研究院+產業園區+產業基金”的模式，推動產業正向發展。探索出以新場景推動新產品，新技術落地的產業發展方式，通過打造比亞迪云巴，成功落地比亞迪動力電池總部。

3．高端創新資源集聚，創新能級持續提升。一是加大國家級創新基地建設。重慶高新區以推動與中國科學院合作為核心抓手，集中布局重大科技基礎設施，開建重慶首個大科學裝置—超瞬態實驗裝置項目，啟動建設中科院重慶科學中心，推動中國自然人群生物資源庫重慶中心、北京大學重慶大數據研究院建成投用。二是強化企業創新平臺建設。兩江新區推動紅宇精工、鐵馬工業、長安、京東方等多家企業與入駐高校院所達成產學研合作，與國家技術轉移東部中心簽訂框架協議，聯合共建滬渝協同創新中心。璧山高新區建成康佳光電技術研究院獲批市級微發光二極管（MicroLED）新型顯示制造業創新中心，成為重慶市第七個制造業創新中心，成功引進戴爾－重慶創新中心、創業黑馬等產業創新孵化平臺。

4.創新創業生態形成，雙創活力顯著增強。一是強化孵化載體建設。重慶高新區大力提升大創谷載體空間功能，致力打造具有全市影響力的高校創新創業基地。新建育成加速器、中關村、清數、大創谷等孵化載體近5萬平方米，“西部（重慶）科學城·中關村智酷人工智能人才培養平臺”揭牌，國家級孵化器和眾創空間增至5個。二是大力開展科技交流活動。重慶高新區積極參與籌備一帶一路科技交流大會，舉辦第五屆全國大學生集成電路創新創業大賽、首屆中國移動“梧桐杯”大數據應用創新大賽（智慧城市賽道）、第六屆清華校友三創大賽（西南賽區）等賽事活動，落實中國創新創業大賽獲獎項目落地實施細則，已兌付7家獲獎企業落地支持資金980萬元，推動“以賽匯智、以賽聚源”已見實效。

5.開放協同創新發展，對外合作成效漸顯。兩江新區加快區域創新合作，在成渝地區雙城經濟圈建設聯動上密切與天府新區相關部門對接“成渝地區協同創新聯盟”建設。深入貫徹落實“一區兩群”協調發展戰略，與萬州區相關部門共同在聯合科研攻關、成果轉移轉化、孵化載體合作、科研資源共享等方面開展合作，助力新區與萬州“1+3”協同發展工作機制體系建設。兩江新區離岸基地建設成效顯著，授牌5個合作中心和3個海外站點，獲批中國科協海智計劃服務科技融合發展行動25萬專項資助和市科協配套100萬元專項扶持資金，舉辦離岸基地海外人才項目系列活動共計20余場，成功引進海外人才項目53個，海外人才62名。

2020年自創區實現地區生產總值達2902.97億元，占全市總量的的11.6%，規上工業總產值達6830.47億元，占全市規上工業總產值的30.1%；有效期內高新技術企業數量達938家，占全市的22.2%。科技研發和服務機構達781家，高新技術企業營業收入達2776.79億元。