近年來，南京高新區(qū)以爭創(chuàng)區(qū)域科技創(chuàng)新中心為目標(biāo)，持續(xù)深化體制機制改革，有效促進了高質(zhì)量發(fā)展。2021年前三季度，南京高新園區(qū)申報高新技術(shù)企業(yè)近6000家，占南京市的比重超過80%；科技型中小企業(yè)入庫數(shù)超過1.2萬家，超額完成全年目標(biāo)，占南京市比重約86%。企業(yè)研發(fā)費用、高技術(shù)制造業(yè)產(chǎn)值、高技術(shù)服務(wù)業(yè)營業(yè)收入，占南京市比重均約80%。南京高新區(qū)已成為南京市企業(yè)科技創(chuàng)新的主陣地。

　　在體制改革方面，“一體化”推進“去行政化”體制改革。南京高新區(qū)按照“企業(yè)化管理、市場化運作、專業(yè)化服務(wù)”的理念，全面開展“去行政化”改革。同時，依據(jù)自身實際設(shè)計績效薪酬考核體系，明確剛性淘汰率，薪酬管理由“鐵工資”向“活薪酬”轉(zhuǎn)變。園區(qū)管理機構(gòu)按需設(shè)崗、動態(tài)優(yōu)化，大幅壓縮管理層級，實行全員競聘上崗，淡化人員身份，實現(xiàn)干部人事管理由“身份管理”向“崗位管理”轉(zhuǎn)變。

　　作為南京開展創(chuàng)新工作的“先手棋”，目前該市新型研發(fā)機構(gòu)已累計備案組建超352家，并全部落戶南京高新區(qū)；作為全新的體制架構(gòu)和運營模式，新型研發(fā)機構(gòu)采用混合所有制形式組建，人才團隊持大股、政府性基金和平臺等多方參與，組成了全新股權(quán)架構(gòu)，形成了以項目化、企業(yè)化形式落地，引入職業(yè)經(jīng)理人作為機構(gòu)“合伙人”的新運營模式。為了大力培育高水平、高標(biāo)準新型研發(fā)機構(gòu)，引導(dǎo)其面向產(chǎn)業(yè)現(xiàn)實需求，突破關(guān)鍵核心技術(shù)，推動科技成果轉(zhuǎn)化為生產(chǎn)力，通過產(chǎn)業(yè)、技術(shù)、學(xué)科的聯(lián)動實踐，推動新的理論探索和研究深化。與此同時，新型研發(fā)機構(gòu)不僅是研發(fā)實體，而且是科技企業(yè)孵化器。目前，新型研發(fā)機構(gòu)孵化科技型企業(yè)超過6000家，使得這些企業(yè)更加聚焦高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)，實現(xiàn)了從“0”到“1”再到“N”的產(chǎn)業(yè)化裂變。

　　在產(chǎn)業(yè)發(fā)展方面，南京高新區(qū)積極推動八大產(chǎn)業(yè)鏈高質(zhì)量發(fā)展。目前，南京高新區(qū)15個高新園區(qū)的主導(dǎo)產(chǎn)業(yè)占各個園區(qū)規(guī)模的60%以上，形成了一園主導(dǎo)、產(chǎn)業(yè)鏈協(xié)同和多園競合等多種布局模式，而且實行“一條產(chǎn)業(yè)鏈，一位市領(lǐng)導(dǎo)，一個工作專班，一位專班負責(zé)人”的“鏈長”工作推進制。

　　南京高新區(qū)還積極推動各園區(qū)新產(chǎn)業(yè)布局，南京高新區(qū)（總部）積極籌建未來產(chǎn)業(yè)促進中心的同時與各園區(qū)積極協(xié)商確定未來產(chǎn)業(yè)的定位，在新的產(chǎn)業(yè)賽道上提前布局。

　　在校地融合發(fā)展方面，南京高新區(qū)大力推進“巷·港·灣”校地融合發(fā)展，引導(dǎo)高校通過共建城市硅巷、大學(xué)科技園、創(chuàng)新灣區(qū)等多種方式參與建設(shè)。例如，玄武園、鼓樓園、秦淮園等與駐區(qū)高校共同推進城市硅巷建設(shè)，盤活主城空間資源，激發(fā)創(chuàng)新活力。東南大學(xué)與江北新區(qū)合作共建東南大學(xué)江北新區(qū)國際創(chuàng)新港，主要推動集成電路設(shè)計自動化。